imagej细胞计数（ImageJ使用教程之自动细胞计数篇） 文/ 利刃君 微信ID/ ziyuanliren666 全文共1626字，推荐阅读时间5分钟。 前面的文章里利刃君为大家分享了ImageJ软件，需要的小伙伴可以戳科研人必备图像处理软件—ImageJ软件分享查看详情。这里利刃君就为大家带来第一篇ImageJ使用教程，在进行细胞实验时，手动数细胞是一件极其无聊又耗费精力的工作，下面我们就看一下如何利用ImageJ实现自动细胞计数，解放我们的双手。自动细胞计数 -壹-导入图像 打开想要处理的图像，这里我们以一张DAPI免疫荧光染色的照片为例进行说明。如下图。 点击File>Open>打开准备好的图像，也可将图片直接拖动到菜单栏，即可打开。如下图。 -贰-将图像转为8-bit 首先需要将图片转为黑白灰的图像，方便后续识别细胞。 点击Image>Type>8-bit，此时图片即已被去色。 -叁-调整阈值，去除背景，选中细胞 ①点击Image>Adjust>Threshold对阈值进行调整，主要是为了选择细胞区域； ②因为利刃君这里选择的是B&W（Black and White），所以图像中黑色的区域就是已经选中的区域，这里可以进行更改，如若改为red，则红色区域为选中的区域； ③另外我们发现Threshold窗口中有两个调节框，我们可以通过左右拖动调节框中的滑块对选择的区域进行调整。原则是尽可能的包含所有的细胞同时去除背景中的杂质。 ④拖动完成后点击Apply，这样阈值就设置好了。 -肆-填补细胞核的空隙 在调节阈值减少背景的同时，可能细胞的一些不均匀部分也被减弱了，这时就需要进行空隙填补，使得细胞变成实心球形来使自动细胞计数的结果更加可靠。 点击Process>Binary>Fill Holes即可，如果没有出现细胞有空隙的情况，则这一步就不需要进行。 -伍-打断细胞核的重叠部分 细胞密度比较大时，通常会有细胞重叠或者贴近的情况。就会导致软件识别时将两个粘连在一起的细胞识别为一个，这时我们就需要利用Watershed自动识别重叠部分，随后再将两个细胞分离开来。 点击Process>Binary>Watershed，此时可以看到粘连在一起的细胞已经被分开。 -陆-自动分析、计数颗粒 点击Analyze>Analyze Particles，出现Analyze Particles界面，根据处理图像的不同，设置不同的参数。 Size：0.05-Infinity——指分析颗粒尺寸大于0.05（一定注意这里的单位是inch），一直到无穷大的颗粒。（根据细胞大小，以及结果好坏来更改）一般可以通过选框工具选择最小的细胞，点击Analyze>Measure来看一下其大小，如我们这里显示Area为104，我们就可以设置Size大小为90-Infinity。 Circularity：0.00-1.00——指圆度，可以根据细胞形状，调整需要的圆度，1.00为标准圆，一般情况下只根据Size进行限制就可以了。 Show：Overlay——指原本图片上会展示出分析结果的外框。 Exclude on edges——处于边缘的颗粒不计入。 设置完成后，点击OK，即出现以下结果，Results窗口中显示了统计出的细胞的数目，并且显示了每个细胞的面积，一共为162个细胞。 另外，我们可以查看原图中有没有漏选或者多选的细胞，如果有可以返回Size设置页面重新设置阈值，再次进行统计。 以上就是利刃君为大家带来的使用ImageJ软件进行自动细胞计数的方法，需要注意的是自动计数的结果并非绝对准确，大家要根据自己的经验优化参数设置，来使结果更加可靠。
土木工程专业学什么（土木工程4问学些什么）土木工程专业学什么（土木工程4问学些什么）国是基建强国，这20多年来，我国的地铁长度高铁长度桥梁数量，摩天大楼的数量等等都是世界第一。这里面，土木专业的毕业生功不可没。土木成劝退专女生学软件工程好吗（女生适合学软件工程专业吗前景如何）女生学软件工程好吗（女生适合学软件工程专业吗前景如何）软件工程是一个很热门的专业，男生学该专业的人数比较多，但是不少女生听说软件工程好就业也心动了，那么女生报考软件工程好不好呢？下facebook是什么意思（facebook是什么）facebook是什么意思（facebook是什么）Twitter（维特）是一家美国社交网络及微博客服务的网站，目前也是全球互联网访问量最大的十大网站之一。它是微博客典型的应用代表facebook是什么意思（facebook是什么）facebook是什么意思（facebook是什么）Twitter（维特）是一家美国社交网络及微博客服务的网站，目前也是全球互联网访问量最大的十大网站之一。它是微博客典型的应用代表男人的精子是什么味道（吃什么补精最快）正常精液带有一种淡淡腥味，这种气味是由于前列腺液中的多胺氧化后产生散发出来的。正常精液具有石楠花的特殊气味，由前列腺分泌物精胺产生。精胺是前列腺分泌液中的重要成分之一，精胺氧化须在女闺蜜是什么意思（闺蜜网名两个字）女闺蜜是什么意思（闺蜜网名两个字）闺蜜是指女性要好亲密无话不谈的好朋友。该词名源自闺中密友，通常闺蜜是用来形容女性的。但是由于女性是一种复杂的生物，近年来闺蜜之间的相处逐渐演变成绿男女闺蜜是什么意思（异性闺蜜）男女闺蜜是什么意思（异性闺蜜）生活中总会见到一些人有非常要好的异性朋友，也就是我们口中常说的异性闺蜜。用比较文雅的词汇称呼红颜知己或是蓝颜知己。男的称呼女的为红颜知己，女的称呼男的男闺蜜是什么意思（男闺蜜是什么）男闺蜜是什么意思（男闺蜜是什么）1类似蓝颜知己，但更加亲密男闺蜜对于女性来说，和蓝颜知己差不多，但是关系更亲密。蓝颜知己可以是虚无缥缈的，男闺蜜却是现实版的，更贴近我们的生活。这种闺蜜是什么意思（闺蜜是什么）闺蜜是什么意思（闺蜜是什么）闺蜜是什么？闺蜜就是在你随时随地想找人倾诉的时候都能找的到人，而且还是一直都在服务区。我和我十多年的闺蜜孙就是这样相处的，每次在我人生中一些大的抉择的时闺蜜是什么意思（闺蜜）闺蜜是什么意思（闺蜜）闺蜜是什么？闺蜜就是在你随时随地想找人倾诉的时候都能找的到人，而且还是一直都在服务区。我和我十多年的闺蜜孙就是这样相处的，每次在我人生中一些大的抉择的时候，我高考分数什么时候出来（高考成绩明日起陆续放榜）高考分数什么时候出来（高考成绩明日起陆续放榜）根据各地此前公布的消息，23日开始，全国各地将陆续进入高考放榜时间。各省份的查分日期是哪天？什么时候开始志愿填报？这些核心信息一起来了