铜死亡机器学习疾病分型，一举拿下非肿瘤疾病生信分析高地！

　　尔云间 一个专门做科研的团队
　　关注我们
　　铜死亡从3月份一经提出，立马火遍生信圈，现在过去半年多仍然热度不减，今天小云就带小伙伴们看看＂铜死亡＂生信的战绩如何！
　　毕竟知己知彼才能百战不殆嘛！搞清楚形势才知道最佳入手方向，来来来，直接看PubMed数据
　　这么看来，铜死亡生信文章大概100来篇，肿瘤相关的就得占90%以上，包括常规预后模型类，肿瘤分型类，泛癌类，关键基因的单基因分析（泛癌）类、铜死亡lncRNA类、多热点联合类等等，大多数常规分析套路都有发表了。
　　换句话说，也就是铜死亡在肿瘤中的想利用简单常规思路发高分的时机已经快过去了，后面比拼的就是思路的创新性和是否加实验。
　　但是，不要慌，这个数据还反应出来一个情况——铜死亡在非肿瘤疾病中生信文章还比较少，发文空间大，也容易发高分！
　　那么，这就是铜死亡生信的突破口了，下面该怎么做朋友们应该晓得了吧？
　　小云就用1篇8分+的铜死亡+机器学习的非肿瘤生信思路，给小伙伴们展示一下
　　小云持续为大家带来最新生信思路，更多铜死亡等创新性分析思路请点击链接。需要复现或定制分析思路call小云，风里雨里小云等你！
　　1. 同一癌种，同样是铁死亡预后模型构建，3分与8分+差在哪里？只因多加了一小步分析筛选！
　　2. 想发高分只分析铜死亡还不够？细胞死亡大军来袭！基于12种细胞死亡模式基因构建预后模型，13分+生信文章轻松收入囊中
　　3. 干细胞仍值当打之年！肿瘤分型+机器学习诊断模型, 10分+生信分析强势出圈，模板思路值得收藏！
　　4. 铁死亡非编码RNA数据库新鲜出炉！借此东风能否迎来生信分析第二春？解决临床问题才是正道~
　　5. 震惊！2张图就能搞定8分+Frontiers生信文章，你不得不知道的＂肿瘤生化复发＂方向！
　　发表时间：2022年11月
　　发表杂志：Front. Immunol.
　　影响因子：IF=8.786
　　文章题目：克罗恩病中免疫浸润和铜死亡相关亚群的鉴定
　　研究背景
　　克罗恩病(CD)是一种由多种病因引起的异质性、功能失调的免疫介导的肠道慢性和复发性炎症。铜死亡是一种新发现的程序性细胞死亡形式，与线粒体功能密切相关，因此铜死亡可能参与CD的病理生理机制。因此，作者致力于研究铜死亡相关基因在CD中的作用。
　　数据来源
　　研究思路及结果
　　文章首先检查了GEO数据中正常人和 CD 个体之间差异表达基因和免疫特征。提取差异基因和铜死亡相关基因进行交集，找到差异表达的铜死亡相关基因(CuDEGs)。此外，利用多种机器学习算法寻找构建通死亡特征的关键CuDEGs，并利用ROC曲线验证关键CuDEGs的诊断性能。随后，分析了关键CuDEGs与免疫浸润细胞的相关性及其富集通路。根据7个关键CuDEGs表达模式将437例CD患者聚类为两个亚组，进行差异基因分析并进一步分析两组间富集通路和免疫细胞的差异。
　　文章小结
　　这个文章分析思路的亮点就是既利用多种机器算法构建诊断模型，又根据关键铜死亡基因进行疾病分型分析。基于铜死亡基因的模型构建和分型放在肿瘤中比较常规，但是挪到非肿瘤疾病领域还是相当够用的，尤其是疾病分型在非肿瘤疾病中做的比较少，再加上本身的诊断模型，数据量和创新性都有所提高，这个思路可以学起来！同时，现在也是个抢占非肿瘤版块铜死亡分析的大好时机，千万不要错过哟！
　　小云有话说
　　想复现这种思路或者了解更多创新性思路call小云，云生信竭诚为您的科研助力！