病毒学家说，自然界找到COVID病毒祖先的机会几乎为零

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　　有证据表明，SARS-CoV-2可能出现在马蹄蝠身上
　　COVID-19病毒可能与蝙蝠冠状病毒有共同的起源。但研究人员说，找到SARS-CoV-2的直接祖先的可能性很小。
　　SARS-CoV-2和几种密切相关的蝙蝠冠状病毒的完整基因组比较分析表明，它们在几十年前有一个共同的祖先。
　　但众所周知，这些病毒会相互交换RNA块，这一过程称为重组，因此每个部分都有自己的进化历史。
　　在11月8日在新加坡举行的第七届世界同一个健康大会上发表的最新分析中，科学家们比较了冠状病毒基因组的片段。分析表明，蝙蝠冠状病毒和SARS-CoV-2的某些部分最近在2016年就有了共同的祖先，就在2019年底该病毒在人类中出现的三年前。
　　研究人员说，这一发现缩短了起源于蝙蝠的SARS-CoV-2祖先与病毒跳到人类之间的时间。然而，它并没有解释SARS-CoV-2的近亲祖先是如何实现这一跳跃的——这是大流行的一个持久谜团，许多科学家认为这可能涉及一种中间动物。直系祖先
　　该研究强调了在蝙蝠中找到SARS-CoV-2的直接祖先是多么困难，因为冠状病毒重新组合的频率和时间已经过去了多少时间。
　　找到直系祖先的机会＂几乎为零＂，澳大利亚悉尼大学的进化病毒学家爱德华·霍姆斯说。＂那艘船已经航行了。＂
　　加州大学圣地亚哥分校的分子流行病学家Joel Wertheim说，SARS-CoV-2的直接祖先可能由几种病毒形成，此后一直在蝙蝠中重组和变异，他为最新分析做出了贡献。
　　对蝙蝠进行冠状病毒采样可能会识别出比迄今为止已知冠状病毒中发现的病毒片段更密切相关的病毒片段，但可能不会揭示一个直接祖先。
　　自大流行开始以来，许多研究人员，特别是在东南亚，一直在对蝙蝠和其他哺乳动物中发现的冠状病毒进行测序。他们还对储存在冰箱中的旧组织样本中的冠状病毒进行了测序，希望找到大流行病毒的起源。
　　但科学家们一直在努力寻找SARS-CoV-2的祖病毒，这导致人们猜测，这场大流行是由一种病毒引发的，该病毒从位于大流行开始的城市武汉病毒研究所意外逃逸。该实验室研究了相关的冠状病毒。病毒亚型
　　到目前为止，已经从蝙蝠和穿山甲中分离出十几种与SARS-CoV-2密切相关的病毒。
　　为了确定它们与SARS-CoV-2的关系，研究人员经常比较他们的整个基因组，这些基因组大约有30，000个核苷酸长。
　　使用这种方法，他们发现SARS-CoV-2的已知最接近的旁系是在老挝发现的一种名为BANAL-52的蝙蝠病毒，其基因组与SARS-CoV-2的基因组相同96.8%。
　　它们的基因组与SARS-CoV-2的基因组之间存在3-4%的差异，这表明自这些病毒共享共同祖先以来，已经进行了大约40-70年的进化。
　　但研究人员表示，比较全基因组序列忽略了重组在病毒进化中的作用。某些RNA块可能与SARS-CoV-2非常不同，这表明它们的亲缘关系更远，而其他更相似的片段则意味着更密切的关系。
　　为了解释重组，研究人员比较了18种与SARS-CoV-2密切相关的蝙蝠和穿山甲病毒，并将它们拼接成27个片段。
　　每个几百到几千个核苷酸的序列片段都有不同的进化历史。对于每个片段，研究人员使用167种相关病毒的更大子集来估计SARS-CoV-2最近与蝙蝠或动物病毒共享共同祖先的情况。几年，而不是几十年
　　分析显示，就在几年前的蝙蝠冠状病毒与SARS-CoV-2有着共同的祖先。
　　大多数片段在2007年左右有一个共同的祖先，但一小块大约250个核苷酸长的片段可能在2016年有一个共同的祖先；另一个550个核苷酸长的片段在2015年——仅在SARS-CoV-2出现在人类中的3-4年之前。
　　最年轻的碎片来自老挝采样的蝙蝠。Lytras说，鉴于这些病毒可以与蝙蝠宿主一起移动的距离，分析表明，东南亚是SARS-CoV-2祖先的热点地区。
　　一些片段很短，这使得这些估计不太可靠，因为只有有限数量的RNA核苷酸可以比较。