医学家的忧虑猴痘病毒正在变异

　　几个月前，当研究人员对猴痘病毒的样本进行测序时，他们有一个令人惊讶的发现。
　　感染者的一个样本中，病毒基因组的很大一部分缺失，另一部分基因已经发生移位到序列中完全不同的位置。
　　猴痘病毒（透射电子显微镜）
　　美国疾病控制和预防中心的微生物学家Crystal Gigante和她的同事们开展了猴痘病毒突变检测。他们在其他一些猴痘基因组中也发现了类似的基因缺失和重排现象。
　　科学家们正在仔细监测情况，以了解为什么会出现这些变化，以及它们对全球猴痘爆发可能意味着什么。
　　这些突变是一个重要的提醒，即使是猴痘病毒这样的DNA病毒， 也会随着时间的推移而变化。DNA病毒往往比SARS-CoV-2冠状病毒这样的RNA病毒进化得更慢 。
　　阿拉巴马大学伯明翰分校的计算病毒学家Elliot Lefkowitz说，猴痘病毒在人与人之间的传播越多，它进化的机会就越多。
　　值得注意的是，Gigante评估的突变并不同于科学家在SARS-CoV-2基因组中看到的单碱基变化。
　　在某些情况下，整个基因已经消失：佛罗里达州感染者的样本中缺少约7%的基因组。
　　但目前无法判断突变对病毒是有益的，中性的还是有害的。Lefkowitz说，如果发现携带这些突变的病毒样本数量增加，这可能是他们正在帮助病毒传播的可能信号。突变类型
　　然而，明尼苏达州首次报道的病毒基因大量缺失和重排并没有让马里兰州贝塞斯达国家生物技术信息中心的进化病毒学家Eneida Hatcher感到惊讶。
　　Eneida Hatcher说，这种突变在大多数痘病毒中很常见，并且它们破坏的大多数基因位于病毒基因组的末端或末端区域。
　　原痘病毒是一种痘病毒，包括猴痘病毒和导致天花的天花病毒，在其基因组中心共享一组约174个基因的核心。
　　但它们的末端区域变化更大，包含的必需基因也更少。Lefkowitz说，这些区域中的一些基因被认为编码有助于解除宿主免疫反应的蛋白质，并且是为感染特定宿主而量身定制的。
　　这为天花为什么变得擅长感染人类提供了一个假设：在数千年的时间里，该病毒的早期版本可能已经从其末端失去了基因，使其能够感染广泛的动物物种，并最终成为感染人类的病毒。天花被根除之前，大约十分之三的感染天花的人死亡。
　　一些科学家担心猴痘可能会出现类似的情况，目前猴痘更像是通才;它可以感染许多哺乳动物，包括几种啮齿动物物种和人类。
　　但是，预测猴痘病毒的行为将如何随着它的突变而变化是很困难的。因为研究人员还没有表征其大基因组中许多基因的功能。
　　例如，尽管研究人员在17年前首次发现两种猴痘病毒株在非洲传播，但他们仍在努力确定哪些基因是造成两者之间死亡率差异的原因。
　　Lefkowitz说。其中一个猴痘病毒株分支I的死亡率约为10%。在西非流行的另一个分支II的死亡率约为1%至3%。基因组合作
　　通过分析猴痘序列，研究人员还更多地了解了该病毒如何引发全球疫情。
　　科学家们已经注意到一种单碱基突变的模式，与明尼苏达州首次发现的变化不同，这似乎是人类免疫系统与病毒之间正在进行的斗争的遗传印记。
　　通过使用迄今为止收集的数据来粗略计算每年预期的这些突变的数量，他们估计导致全球爆发的菌株在2016年初从动物跳到了人类身上。
　　这是尼日利亚卫生官员首次在人类中发现该菌株之前的一年半多，他们宣布在他们的国家爆发了从未完全结束的疫情。
　　好消息是，尽管猴痘病毒继续进化，但没有突变影响其基因组中编码tecovirimat靶向蛋白质的部分。tecovirimat是一种抗病毒药物，正在测试用于对抗人类猴痘。
　　但诊断测试中最终可能会出现问题。为了检测样品中的猴痘病毒，技术人员进行聚合酶链反应（PCR）以检测病毒基因组中的靶序列。
　　Gigante和她的同事发现，在他们分析的一个样本中，猴痘靶标的两个拷贝中的一个拷贝的tecovirimat靶向蛋白质基因缺失了。尽管PCR测试是阳性结果，但Gigante警告说，这些类型的突变可能最终使检测无效。
　　哈彻说，全球对猴痘的关注不仅将帮助研究人员了解导致这种疾病的病毒，而且还将更广泛地了解痘病毒。
　　在今年之前，只有大约100个近乎完整的猴痘基因组存在。现在，大约2，000个已存入已建立的国际存储库。监测基因组序列的国际合作在COVID-19大流行之后仍需要继续存在。