美国国家生物技术信息中心的基因表达数据库（GEO）项目是为了应对高通量基因表达数据公共存储库日益增长的需求而发起的。基因表达数据库（GEO）提供了灵活和开放的设计，便于从高通量基因表达和基因组杂交实验中提交、存储和检索不同类型的数据集。基因表达数据库（GEO）的目的不是要取代内部的基因表达数据库，这些数据库受益于连贯的数据集，并且构建这些数据库是为了促进特定的分析方法，而是通过充当第三级中央数据分发中心来补充这些数据库。基因表达数据库（GEO）的三个核心数据实体是平台、样本和系列，设计时考虑到了基因表达和基因组杂交实验。从本质上讲，平台是一系列探针，它们定义了可以检测到的分子集。一个样本描述了正在被探测的一组分子，并引用了用于生成其分子丰度数据的单一平台。一系列将样本组织成有意义的数据集，这些数据集构成了一个实验。基因表达数据库（GEO）可通过万维网公开访问。 网源网络 设计 基因表达数据库（GEO）将数据分成三个主要组件，平台、样本和系列，每个组件都在关系数据库中访问(即给定唯一和恒定的标识符)。为了实现开放和灵活的设计，允许存储和检索非常不同的数据类型，数据没有在数据库中完全细化。取而代之的是，为每个平台和每个示例存储制表符分隔的ASCII表。该表由多个列以及相应的列标题名称组成。此表中的数据目前部分提取用于编制索引，但可能会进一步提取以进行更广泛的搜索和检索。此外，提交者可提供任意数量的补充列，以包括提交者定义的附加信息。 图源网络 平台的实例本质上是一系列探针，它们定义了在利用该平台的任何实验中可以检测到的分子集。例如，平台数据表可以包含标识每个探针(SPOT)的位置和生物试剂含量的GEO定义的列，诸如GenBank登录号、开放阅读框架(ORF)名称和克隆识别符，以及提交者定义的列。平台登录号有一个‘GPL’前缀。 一个样本的实例描述了正在被探测的一组分子的派生，并利用平台来产生分子丰度数据。每个样本都有且只能有一个必须预先定义的父平台。例如，样本数据表可以包含指示在其平台中定义的相应斑点的最终相关丰度值的列，以及任何其他由GEO定义的(例如，原始信号、背景信号)和提交者定义的列。样本登录号有一个‘GSM’前缀。 序列的实例将样本组织成组成实验的有意义的数据集，并由共同的属性绑定在一起。系列登录号有一个‘GSE’前缀。 提交 对于新提交的和更新的提交，有两种通信模式可用，即交互或直接存放。交互式Web表单界面路线简单明了，最适合偶尔提交数量相对较少的样本。通过直接存放简单总括格式(SOFT)的文件，可以将大量提交的大量数据集迅速并入地球观测组织。SOFT是一种基于行的ASCII文本格式，允许在一个文件中表示多个GEO平台、样本和系列。在Soft中，元数据显示为标签-值对，并与平台和示例的制表符分隔的文本表相关联。Soft的设计使其易于使用现成的行扫描软件进行操作，并且可以非常容易地从电子表格、数据库和分析软件中生成或导入其中。有关SOFT和提交过程的更多信息，可从网站获得。 提交可以私下保存最多6个月；这项政策允许数据发布与稿件发布一致。这些提交的材料有一个最终的加入号，可能会在出版物中引用。在这一点上，提交的文件不是经过整理的，而是经过人工扫描，以确保满足最低基本要求。通过使用数据表中的标准列标题并提供足够的补充信息，使数据对其他人有用完全取决于提交者。 搜索和检索 在编写本报告时，仅通过登录号就可以检索完整的平台、样本和系列提交的材料。对GEO中的数据进行了广泛的索引和链接，并可通过名为Entrez ProbeSet的新Entrez数据库进行查询。这个数据库的Web界面使用与其他流行的NCBI资源(如PubMed和GenBank)相似的索引和链接引擎。与任何其他Entrez数据库一样，可以输入一个简单的布尔短语，并将其限制为任何数量的受支持属性字段。匹配项链接到完整的GEO条目以及其他Entrez数据库--目前是核苷酸、分类和PubMed-以及相关的Entrez ProbeSet条目。Entrez ProbeSet可通过Entrez网站作为用于选择要查询的Entrez数据库的下拉菜单之一进行访问。 未来的发展 基因表达数据库（GEO）正在不断开发，目的是改进其索引、链接、搜索和显示能力，以便能够进行更有力的数据挖掘。作为GEO储存库的扩展，我们目前正在开发一个完全细化的丰度测量数据库，该数据库将允许查询和检索单个丰度测量结果。然而，在当前高通量基因表达和基因组杂交实验的复杂性和快速发展带来的限制下，丰度测量可能只在类似派生的小组数据集内具有可比性。我们计划利用这些可比较的数据子集，以便尽可能多地查询丰度测量数据，以及提供这些数据的有用的概观。 英文原文 Edgar R, Domrachev M, Lash AE. Gene Expression Omnibus: NCBI gene expression and hybridization array data repository. Nucleic Acids Res. 2002 Jan 1;30(1):207-10. doi: 10.1093/nar/30.1.207. PMID: 11752295; PMCID: PMC99122.
令人心动的三行情书七夕写给你爱的他（她）吧想与你站在世界的尽头共赏这尘世的繁华不休然后一起等大雪染白了双鬓神明把风交给霁月，把樱花交给春天，把黑夜交给星光，把心跳交给脸红，把我交给你。全天下的温柔共十分，你占八分你喊我名字林武在八一前夕走访慰问驻晋某部卫国先锋连向驻晋部队官兵和广大退役军人致以节日问候七月二十九日，省委书记省军区党委第一书记省国防动员委员会第一主任林武来到中国人民解放军66016部队，走访慰问基层连队官兵，并听取连队历史沿革和所获荣誉介绍，勉励部队发扬能征善战拥我只想过我爱的生活一个人，总是知道自己想做什么，不想做什么，那就勇敢做自己，过自己热爱的生活！由于每个人都是如此不同，自然做的事也不同，所以，做独一无二的自己，也允许他人做他自己，毕竟，我们每个人都为什么说臭汗源于肝，虚汗源于肺，冷汗源于肾！今天给你讲明白为什么说臭汗源于肝，虚汗源于肺，冷汗源于肾今天，给你讲明白！为什么说臭汗源于肝，虚汗源于肺冷汗源于肾。这是为什么？又该如何调理呢？首先是臭汗源于肝。如果你平常总是爱生气爱着急情志不志愿军刚到朝鲜，金日成就要指挥志愿军，彭总你指挥过多少军队在1950年的时候，有着16个国家组合成了联合国军入侵了朝鲜，直接就逼近了中国的边境，这个时候毛主席就指派了彭德怀，让他去率领军队去支援朝鲜，我国和朝鲜一起打了两年，最终打赢了，迫解放军进入一级战备状态，有多可怕？解放军进入一级战备有多可怕？中国人民解放军战备等级总共分为四级。数字越小，战备等级越高。解放军进入一级战备状态，那就说明中国直接面临军事武装入侵或即将爆发军事冲突。那么，按照人民解一张深圳肯德基偷拍照火上热搜，我顿悟了成年人最高级的善良前些天，在广东深圳的一家肯德基，有人拍下了一段这样的视频。一个戴着口罩的女孩在打视频电话，但全程不说一句话，只是着急地在镜头前用手比画着。拍摄者以为女孩在秀恩爱，还配上了唯有爱不被CBA大交易达成！曝周鹏签约深圳队，CBA争冠局面洗牌，新王朝诞生日前，根据国内媒体人刘宝杰的爆料，广东男篮功勋队长周鹏正式签约了深圳男篮。广东男篮此前流传出的转会传闻看来所言非虚，而正在步入职业生涯末期的周鹏能够继续迎接新的挑战，我们也是衷心敬西行纪如来实力到底如何？在整部动漫中大概排名第几？又到了周三，大家拭目以待的西行纪又更新啦，这一集主要讲的就是天界和暗魂之间的战斗，主要出场的是悟空，还有唐三藏等人大战古龙，很有看头哦！孙悟空来天界，就是如来让他来了，如来其实早就10部曾被封神的动漫，却因续作口碑惨遭崩坏涙音乐MISIATV機動戦士鉄血OriginalSoundTracks崩坏续作最后受伤的还是我们这些粉丝近几年，崩坏的动画特别多，由于每季新番已经高大50多部，制作资源和人才问题，推荐十部运动类动漫，看看你都看过那一部？第一部Yuri！！！onICEYuri！！！onICE，是2016年由动画公司MAPPA制作的动画，故事以花式滑冰为题材，动画中将滑冰画面绘制得生动流畅，描写了该运动展现的美丽与艺