人类基因组序列终于完整面世
耗廿多年寻找最后拼图 基因「暗物质」重见天日
被誉为生命科学「登月计划」的人类基因组测序再次取得重大进展,国际科学团队端粒到端粒联盟(T2T)前日发表了第一个完整的、无间隙的人类基因组序列,不仅填补先前研究人员努力后仍遗留下的空缺,同时也为全球79亿人口寻找有关致病突变、老化和遗传变异的线索,提供了新的希望。
人类基因组测序是一项已经持续30多年的庞大工程,由6国科学家共同参与的国际人类基因组计划(HGP)早于1990年已经展开这项工程,并于2001年2月12日首次公布人类基因组图谱及初步分析结果;2003年4月15日,HGP进一步公布人类基因组序列草图。然而由于技术限制,当时号称的「完整序列」实际仍留下了大约8%的「空白」间隙。
这部分未被测序的基因由高度重复、复杂的脱氧核糖核酸(DNA)块组成,其中包含功能基因以及位于染色体中间和末端的着丝粒和端粒,由于难以跟其他部分相啮合,难以进行测序。多年来一直参与人类基因组测序工作的华盛顿大学研究员艾希勒说:「一些使我们独特地成为人类的基因,其实就存在于这些基因组的『暗物质』中,它们完全被遗漏了。花了20多年时间,我们终于完成了。」
较旧版本增2亿碱基对
为了报告这项成就,T2T的研究人员在最新一期《科学》期刊连发6篇论文,并将新的无间隙版本标准人类参考基因组序列命名为「T2T-CHM13」。新序列由30.55亿个碱基对和19,969个蛋白质编码基因组成,较此前版本增加了近2亿个碱基对的新DNA序列,包括99个可能编码蛋白质的基因和其中近2,000个需要进一步研究的候选新基因。
这些候选新基因大多数已没有作用,但其中115个仍然可能有活性。团队还在人类基因组中发现了大约200万个额外的遗传变异,其中622个出现在与医学相关的基因中。此外,新序列还纠正了此前版本基因组中的数千个结构错误。
新细节揭示人类演变
具体而言,新序列填补的空白包括人类5条染色体的整个短臂,并覆盖了基因组中一些最复杂的区域。其中包括在重要的染色体结构中及其周围发现的高度重复的DNA序列,如染色体末端的端粒和在细胞分裂过程中协调复制染色体分离的着丝粒。新序列还揭示了以前未被发现的节段重复,即在基因组中复制的长DNA片段,已知其在进化和疾病中发挥重要作用。
新序列还在识别和解释遗传变异方面具有重要改进,并揭示了关于着丝粒周围区域的前所未见的细节。这一区域内的变异性可能为人类祖先如何进化提供新证据。
有望降低个人测序成本
研究人员称,这一完整的、无间隙的序列对于了解人类基因组变异的全谱和了解某些疾病的遗传贡献至关重要。研究人员表示,下一阶段的研究将对不同人的基因组进行测序,以充分掌握人类基因的多样性、作用以及我们与近亲、其他灵长类动物的关系。
T2T联席主席菲利普说,完整的人类基因组序列今后将有助大大降低个人基因组测序的成本和时间,「在不久将来,当某个人想将他的基因测序,我们将可以找到他的所有DNA变异,并利用有关信息更好地帮助他管理健康。」菲利普形容真正完成人类基因组测序「就像戴上一副新眼镜」,「我们终于可以看清楚所有东西,离了解他们的意义又前进了一步。」(来源:香港文汇报)
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