Omicron（奥密克戎）简史

　　2021年 11月24日, 南非首次从2021年11月9日采集的患者样本中发现SARS-CoV-2变异体B.1.1.529（Omicron），并于同年11月26日被世界卫生组织（WHO）认定为令人担忧的新变异体。这一变异株被发现具有比以往任何一种病毒更高的突变数量。SARS-CoV-2一直在通过突变改变其遗传密码。这些突变主要发生在病毒的刺突蛋白上，导致被称为＂变异体＂的病毒的轻微修改拷贝，并使该病毒株具有独特的特性，如传染性和疾病严重程度的改变，从而导致新的感染传播率、发病率和死亡率。这种新的＂Omicron变异株＂非常令人担忧，因为它有几十种变异，可以影响其行为方式。
　　突变采用字母和数字命名，如D614G，表示病毒刺突蛋白3第614位的氨基酸从D（天冬氨酸）变为G（甘氨酸）。WHO已确定5种变异毒株，即Alpha、Beta、Gamma、Delta和最新的一种Omicron变种。除此之外，目前还正在监测着2个被命名的VOIs (感兴趣的变异株)和7个VOM（正在监测的变异体）的致病性。
　　SARS-CoV-2的B.1.1.529或Omicron变异体包括五个谱系，即BA.1，BA.2，BA.3、BA.4和BA（表1）。目前，WHO根据四个标准决定Omicron对人群的威胁程度：病毒传播性；既往感染和疫苗对传播、感染、疾病严重程度和死亡率的保护程度；与其他变异体相比，该变异体的毒性如何；以及人们如何遵循低公共卫生和社会措施来应对病毒的出现。根据现有证据，SARS-CoV-2的Omicron变种具有更高的传染性，在社区中传播更快，比新冠肺炎大流行中先前确定的其他变种发病率更高。截至2022年6月20日，英国和美国报告了近120万例Omicron或B.1.1.529变体感染病例。在过去的半年时间里，B.1.1.529的几个已确定的亚株已在全球迅速蔓延（表1, 2）。尽管感染B.1.1.529变异株或Omicron变异株的严重疾病和死亡风险比以前的SARS-CoV-2变异株低，但极高的传播水平导致住院人数显著增加，全球医疗系统面临巨大需求。
　　表 1. SARS-CoV-2的B.1.1.529或Omicron变异体五个(Pango)谱系包括BA.1、BA.2、BA.3、BA.4和BA.5
　　Omicron谱系
　　首次检测的地理区域
　　首次检测日期
　　被命名日期
　　WHO状态
　　B.1.1.529
　　南非
　　2021.11.24   2021.11.26
　　被命名为VOC
　　VOC
　　BA.1*
　　南非
　　2022.1
　　2022.2.22再次被命名为VOC
　　VOC
　　BA.2*
　　南非
　　2022.1
　　2022.2.22再次被命名为VOC
　　VOC
　　BA.3
　　南非
　　2022.1
　　未命名–全球范围内被检测到，但病例很少
　　未命名
　　BA.4*
　　南非
　　2022.1
　　2022.6.7被命名为VOC-LUM
　　VOC-LUM
　　BA.5*
　　南非
　　2022.1
　　2022.6.7被命名为VOC-LUM
　　VOC-LUM
　　*WHO建议，公共卫生当局应将这些B.1.1.529子代谱系作为不同谱系进行监测，并对其病毒特征进行比较评估。VOC，变异毒株；VOC-LUM–监测中的变异毒株。摘自WHO，SARS-CoV-2变异体，2022年6月7日。
　　表 2. 截至2022年6月7日，纳入WHO监测的变异毒株谱系（VOC-LUM）的Omicron谱系
　　Pango 株命名法
　　与Omicro VOC的关系
　　首次检到的地理区域和日期
　　BA.4*
　　BA.1和BA.2的姐妹株
　　南非，2022.1
　　BA.5*
　　BA.1和BA.2的姐妹株
　　南非，2022.1
　　BA.2.12.1
　　BA.2的亚株
　　美国，2021.12
　　BA.2.9.1
　　BA.2的亚株
　　多国，2022.2
　　BA.2.11
　　BA.2的亚株
　　多国，2022.3
　　BA.2.13
　　BA.2的亚株
　　多国，2022.2
　　*2022年5月12日，欧洲疾病预防和控制中心（ECDC）从感兴趣变异体（VOI）到变异毒株（VOC）重新分类BA.4和BA.5亚株。摘自WHO，SARS-CoV-2变异体，2022年6月7日。
　　截至2022年6月20日，英国和美国报告了近120万例Omicron或B.1.1.529变体感染病例。在过去的六个月里，B.1.1.529的几个已确认的亚株在全球迅速蔓延。最初确定的谱系包括BA.1和BA.2。然而，BA.4、BA.5和亚株BA2.12.1现在在欧洲和美国占优势。2022年5月12日，欧洲疾病预防控制中心（ECDC）将BA.4和BA.5从感兴趣的变异体（VOI）重新分类为变异毒株（VOC）。人们越来越担心，以前感染SARS-CoV-2和使用这些变异体出现之前开发的疫苗接种可能无效。
　　最近的人口和实验室研究支持对新的SARS-CoV-2 变异体Omicron谱系和亚株的潜在威胁的担忧。2022年6月17日，《自然》杂志报道了BA.2.12.1，BA.4和BA.5表现出比BA.2更高的传播力。刺突（S）蛋白的结构比较显示BA2.12.1和BA.4/BA.5具有与BA.2相当的血管紧张素转换酶2（ACE2）结合亲和力。此外，BA.2.12.1，BA.4和BA.5与BA.2相比，当针对三倍疫苗接种患者和BA.1感染患者的血浆进行测试时中和逃逸增加。对中和抗体的表位分布和Omicron中和效力的研究表明，Omicron可能会进化出突变，以逃避BA.1感染后的体液免疫反应。因此，BA.1衍生的疫苗加强剂可能无法获得足够的免疫保护新的Omicron谱系。实验室研究表明，接种疫苗后产生的抗体在阻断BA.4和BA.5病毒的效果不及早期的Omicron变异体，包括BA.1和BA.2，可能是由于BA.4和BA.5中的L452R和F486V棘突突变。
　　因此，由于Omicron之 VOCs的全球传播越来越快，随后预计病毒多样性也会增加。WHO于2022年6月7日在其SARS-CoV-2变种追踪系统中增加了一个新类别。VOC-LUM倡议旨在向全球公共卫生当局通报可能需要优先关注和监测的VOC谱系（表2）。VOC-LUM的主要目标是调查这些谱系是否对全球公共健康构成额外威胁。如果任何谱系显示出与原始VOC相比可能增加疾病发病率或严重程度的独特特征，TAG-VE和WHO可将该病毒确定为VOC-LUM。
　　SARS-CoV-2的B.1.1.529或Omicron变异体目前是全球流行的主要变体。Omicron的一些亚株与其他循环VOC谱系和突变变化相比显示出传播优势，这赋予了传播或感染优势。例如，包括英国在内的一些国家已经让公共卫生当局意识到Omicron的BA.2可能具有传播优势，这解释了其日益流行的原因，包括居家医疗。
　　WHO 的VOC-LUM倡议的主要作用包括：审查全球病毒流行病学；跟踪全球传播；通过WHO生物中心共享病毒分离物；将完整的基因组序列提交到公开可用的数据库；提高VOC-LUM对新冠肺炎流行病学潜在影响的认识；以及VOC-LUM对相关病毒特征影响的实验室评估。
　　结论
　　WHO制定了新的VOC-LUM倡议，以重新认识Omicron（或B.1.1.529，SARS-CoV-2变种）新谱系和亚株的重要性。由于突变率高，Omicrons（或B.1.1529，SARS-CoV-1变种）的新谱系或亚株的出现可能会继续下去。令人担忧的是，随着人群中SARS-CoV-2检测的减少，由于缺乏病毒基因组数据，新兴病毒的流行病学前景可能变得不明朗。
　　参考文献：
　　[1]   MenniC, et al. Symptom prevalence, duration, and risk of hospital admission in inpiduals infected with SARS-CoV-2during periods of omicron and delta variant dominance:a prospective observational study from the ZOE COVID Study. Lancet, 2022;339:1618-24.
　　[2] Parums DV. Editorial: World Health Organization (WHO) Variants of Concern Lineages Under Monitoring (VOC-LUM) in Response to the Global Spread of Lineages and Sublineages of Omicron, or B.1.1.529, SARS-CoV-2. Med Sci Monit, 2022; 28: e937676.