影响鸡肉中亚油酸含量关键基因及调控通路
亚油酸是一种人体不能合成必须从饮食中获得的多不饱和必需脂酸。对人类的健康和正常的生理功能起着重要的作用。而鸡肉作为我国的第二大消费肉类,是百姓获取亚油酸的途径之一。亚油酸不仅能带来健康同时还能对肉品质和肉风味产生影响。为公众提供更有营养、更健康、更美味的鸡肉是当代育种工作的终极目标。但鸡肉中影响亚油酸含量沉积的候选基因尚不清楚。
近期, 中国农业科学院鸡遗传育种创新团队联合 佛山科学技术学院广东省动物分子设计与精准育种实验室 在 Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文),JIA) 在线发表了题为 " Transcriptome-based analysis of key genes and pathways affecting the linoleic acid content in chickens" 的研究。
该研究以广东优质地方品种清远麻母鸡为素材,共399个个体,在上市日龄进行脂肪酸组成的测定及转录组测序。采用加权基因共表达网络分析(weighted gene coexpression network analysis, WGCNA)方法构建鸡肉中亚油酸含量共表达基因模块,筛选影响亚油酸含量的候选基因。并对相关性最高的模块中的基因进行KEGG富集分析。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法共鉴定到8个相关基因模块( P <0.05)。选取|GS|>0.2和|MM|>0.8这一条件筛选枢纽基因(hub gene),筛选到 MDH2 , ATP5B , RPL7A 和 PDGFRA 等4个关键基因。KEGG富集分析后共获得13条显著相关的代谢途径。其中 MDH2 和 ATP5B 参与多条代谢途径。这一研究结果将有助于开展鸡体内亚油酸沉积和代谢的调控机制研究,同时也为培育优质品种鸡提供潜在候选分子标志。
Fig. 3 Heatmap of linoleic acid and module correlation.
Fig. 4 Correlation chart: Correlation between module membership (MM) and gene significance (GS). The correlation between the linoleic acid content and the module of interest is indicated. A, "MEcyan" module. B, "MEgreen" module. C, "MEbrown" module. D, "MEblack" module. E, "MEmidnightblue" module. F, "MEdarkgray" module. G, "MEplum1" module. H,"MEdarkmagenta" module.
Fig. 5 Correlation module pathway enrichment analysis.
赵雯娟 硕士为论文的第一作者, 赵桂苹 研究员、 李华 教授为论文的通讯作者。该研究得到国家现代农业产业技术体系资助(CARS-41)、广东省重点领域研究发展计划(2020B020222002)等项目的资助。
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https://doi.org/10.1016/j.jia.2023.02.019
Cite the article: ZHAO Wen-juan, YUAN Xiao-ya, XIANG Hai, MA Zheng, CUI Huan-xian, LI Hua, ZHAO Gui-ping. 2023. Transcriptome-based analysis of key genes and pathways affecting the linoleic acid content in chickens . Journal of Integrative Agriculture , Doi:10.1016/j.jia.2023.02.019.
Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文), JIA) 由中华人民共和国农业农村部主管,中国农业科学院与中国农学会主办,中国农业科学院农业信息研究所承办。综合性英文学术期刊,月刊。创刊于2002年,现任主编为中国工程院院士、中国农业科学院副院长王汉中。JIA主要栏目有作物科学、园艺、植物保护、动物科学、动物医学、农业生态环境、食品科学、农业经济与管理等。刊稿类型有综述、研究论文、简报以及评述等。全部论文在Elsevier-ScienceDirect (SD) 平台OA出版。最新SCI影响因子4.384,位于SCI-JCR农业综合学科Q1区。中科院分区农林科学1区。2016年以来先后获得中国科协等部委 "提升计划""登峰计划""卓越计划"项目支持。
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